La década que abarca de 1992 al 2001 se vio marcada por una serie de cambios estrepitosos en la geopolítica mundial con los atentados terroristas a los Torres Gemelas en Estados Unidos así como otra serie de instalaciones en las que se usaron aviones, pero en México una crisis económica con el error de 1994 dejó en la calle a millones de ciudadanos y en Jalisco la cara de la ciudad cambio después de las explosiones del 22 de abril de 1992, lo que marcó a la ciudad y en el corto plazo el inicio de la alternancia política en la esfera de gobierno, todo en medio de una transición de milenio.
La mañana del 22 de abril de 1992 la ciudad de Guadalajara se despertó de forma abrupta tras de que más de 10 kilómetros de drenaje explotó debido a la acumulación de hidrocarburos, que a la fecha nadie se hace responsable de esa situación que dejó a miles de personas dañadas en sus propiedades y muchas de ellas migraron a otras zonas.
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Pero sin duda marcó el inicio de la debacle política del Partido Revolucionario Institucional ya que generó la salida del Gobernador Guillermo Cosío Vidaurri y la llegada interina de Carlos Rivera Aceves quien estuvo hasta 1995 y presenció cómo la gente votó por el candidato del Partido Acción Nacional, a esos sucesos es necesario sumarle el homicidio del Cardenal Juan Jesús Posadas Ocampo, en el aeropuerto en una aparente equivocación ya que el objetivo era un líder del narcotráfico.
Con Alberto Cárdenas Jiménez, Jalisco fue la cuarta gubernatura que logró el PAN en su historia. Otorgó una mayor libertad de expresión y manifestación, creó la Secretaría de Seguridad Pública; el Instituto Jalisciense de Ciencias Forenses; el Consejo Ciudadano de Seguridad Pública y la Secretaría de Medio Ambiente y Desarrollo Sustentable.
En esta época se dio inicio a la administración de Francisco Ramírez Acuña y se caracterizó por el impulso a las obras de infraestructura, destacando la carretera regional Guadalajara-Puerto Vallarta, los ingresos sur por Avenida López Mateos y oriente en el Nodo Revolución, se impulsó el rescate y restauración de la zona arqueológica Los Guachimontones, en Teuchitlán y dotó a los municipios de Museos, bibliotecas y Casa de la cultura.
A nivel nacional concluía la polémica presidencia de Carlos Salinas de Gortari, el inicio de la de Ernesto Zedillo y la alternancia en el 2000 con la llegada de Vicente Fox enarbolando la bandera del PAN y con lo que acaba la hegemonía presidencial del PRI por más de 70 años.
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En este periodo se dio el asesinato de Luis Donaldo Colosio como candidato presidencial y que dio paso a la candidatura de Zedillo Ponce de León, quien tuvo que enfrentar una severa crisis financiera llamada Efecto Tequila, tras la libre flotación de la paridad peso ante dólar que causó una fuga masiva de divisas, además del levantamiento del Ejército Zapatista de Liberación Nacional en Chiapas.